玩笑開(kāi)過(guò)頭的托馬斯約瑟夫·梅 Joseph May 配音)不小心將高登的車廂脫了軌道,為了懲罰馬斯,胖總管將他分到多多島的的另一端作,與新朋友萊恩(迪·雷德梅恩 Eddie Redmayne 配音)一起建造新的火車支線。托馬斯重新展示自己是有用火車,在新鐵路上行時(shí)未有留意危險(xiǎn)告示結(jié)果墜落裂縫的地洞竟發(fā)現(xiàn)傳說(shuō)中的海盜,并與水手約翰(約·赫特 John Hurt 配音)和帆船斯基夫(杰米·噎貝·鮑爾 Jamie Campbell Bower 配音)結(jié)伴,在多多島展開(kāi)滑魚(yú)張激的尋寶之旅…?