“闇之書事”（參照魔少女奈葉A's）的10年后。踏入19歳的高町奈、菲特·T·哈洛溫、八疾風三人，抱著彼此的情牽絆、為追求各自的想實現(xiàn)而加時空管理局并以一流魔師的身分活。 　　在此當中，出現(xiàn)新發(fā)現(xiàn)的太遺產(chǎn)“圣遺石”（レリク），以及此為目標而現(xiàn)的謎樣機兵器“共鳴發(fā)者”（ガェットドロン）。為了速對應日后稱為“圣遺石事件”的況，八神疾考慮到設置夠迅速對應獨立部隊的要性，設立專責處理與古遺產(chǎn)關連務的特殊部——“機動課”。 　　另一邊，時回溯到四年。昴·中島遭到機場火卷入而幾乎命之際，由奈葉的出現(xiàn)得救。因為憬著如同“己理想中的象”一般的葉，昴在當的滿天星空下，做出了成為管理局魔導師”的定。 　　四年后，經(jīng)過番波折而順成為管理局新進魔導師昴，與訓練時代的伙伴雅娜·蘭斯共同挑戰(zhàn)魔師的升格試。于遠處凝著兩人考試，分別是認兩人將成為機動六課”明日之星而以注意的疾與菲特、還奈葉。在三的注視之中隨著宣告試開始的ReinForce II（統(tǒng)御之力zwei）的聲音，開了“StrikerS”故事的序幕