位于東京西部的大“學(xué)園都市”在總?cè)丝谶_(dá)230萬(wàn)人，其中約8成是學(xué)生的這座都中，實(shí)施著超能開(kāi)發(fā)的特殊課程學(xué)生們的能力被予從“無(wú)能力Level 0”到“超能力Level 5”的六階段評(píng)價(jià)。高中生上條麻，也是住在學(xué)都市的學(xué)生之一他由于隱藏在右中的力量——只是異能之力，就神的加護(hù)都能消的“幻想殺手Imagine Breaker”，而被評(píng)價(jià)為名落孫的“無(wú)能力”，著充滿不幸的人。而上條的學(xué)生活，由于暑假開(kāi)時(shí)從天而降的純修女而發(fā)生了巨的變化。自從與離“魔法”世界她——“禁書(shū)目茵蒂克絲”相遇始，上條就被卷了各種各樣的事中。統(tǒng)率學(xué)園都的“科學(xué)”方、茵蒂克絲關(guān)聯(lián)的魔法”方，在驚地解決雙方事件過(guò)程中，他的人關(guān)系也逐步擴(kuò)展之后，魔法一方十字教最大宗派馬正教，終于注到上條的存在…。如同呼應(yīng)魔法一般，科學(xué)方的園都市也有所動(dòng)。但也有與逐漸始對(duì)立的世界動(dòng)抗?fàn)幍娜瞬粩喑?。那些通過(guò)與上有所關(guān)聯(lián)，而使運(yùn)大為改變的“雄”們。他們挺而出與世界對(duì)峙如同上條當(dāng)麻做的那樣?？茖W(xué)與法第三次交織之，故事將大幅推！?