正在調(diào)查墜落在太平洋的不明飛行物體的海上衛(wèi)隊(duì)二尉有動(dòng)貴文（大賢也），遇到了突然出的藍(lán)光，受發(fā)光體的影，導(dǎo)致遺傳因子標(biāo)準(zhǔn)的質(zhì)，變成了兇惡的怪獸THE ONE。之后，他（THE ONE）從防衛(wèi)廳內(nèi)的特殊機(jī)關(guān)BCST（對(duì)生物工程學(xué)的研究機(jī)關(guān)）的監(jiān)視下逃走，此就沒(méi)了音訓(xùn)。另一方，航空自衛(wèi)隊(duì)F15J飛行員真木舜一（別所哲），為了多點(diǎn)時(shí)間陪伴有先天性疾病的兒子繼決定辭去官職。在最后次飛行中真木與“紅色光體”在空中相遇。這the one事件后3個(gè)月發(fā)生的事情。但是木奇跡般地生還，然后職成為了民航機(jī)飛行員展開(kāi)了新生活。對(duì)這樣真木還是有機(jī)關(guān)非常關(guān)，尤其是BCST中的化學(xué)擔(dān)當(dāng)官水原沙羅，BCST將真木強(qiáng)制帶走，在廢工廠中搭建的BCST研究室進(jìn)行身體上的監(jiān)。此時(shí)行蹤不明的怪獸THE ONE像被某種東西吸引而回來(lái)了。遭受THE ONE攻擊而瀕死的真木，身體發(fā)生了變，在紅色光球的力量之變身了！變成身高10M擁有銀色光芒的鋼鐵身型態(tài)，偶而還有自己意的真木，跟THE ONE展開(kāi)作戰(zhàn)，但是因?yàn)樽兩聿煌耆_羅量快速消，在遭到?jīng)Q定性的一擊變回了真木舜一的型態(tài)然后沙羅將這個(gè)在THE ONE之后出現(xiàn)的生命體定名為“THE NEXT”。真木在從東京被護(hù)送回BCST研究室的途中得知了兒子繼夢(mèng)入的消息,在趕到醫(yī)院后跟妻子蓉子再次的碰面了此時(shí),人類最大的危機(jī)出現(xiàn)了,在吸收了各式各樣的生物進(jìn)入體內(nèi)而產(chǎn)生異的"THE ONE"重返出現(xiàn)在新宿的街道上,從口中發(fā)出的的超絕火光彈將街道燒毀殆盡有的人格已經(jīng)被"THE ONE"取代,已經(jīng)成為不能變回為人的狀態(tài)。不那樣的有慟以前與水原羅卻是有著婚約的情侶了沙羅心中的回憶，并為了跟兒子繼夢(mèng)的約定為了保護(hù)心愛(ài)的家族，木再次變身。那個(gè)姿態(tài)加進(jìn)化成巨大化40m，在間接部有像流血般的色，兩肘的特征是出現(xiàn)刀。現(xiàn)在，以新宿副市心為舞臺(tái)，ULTRAMAN與"THE ONE"的決戰(zhàn)之火開(kāi)始燃燒了